El Fondo de Cohesión se destina a proyectos de transporte y de medio ambiente y lo reciben los países con un PIB per cápita inferior al 90% de la media comunitaria. En el periodo 2000-2006 España recibirá 11.160 millones de euros (1,85 billones de pesetas).

La mayor parte de las ayudas destinadas a medio ambiente se destinan al saneamiento y depuración de aguas (43% del total) y a la gestión de residuos (34%). Otro 20% financia obras de abastecimiento de agua y el 3% se dedica a mejorar el medio ambiente urbano.

Estos fondos, unidos a la financiación de las demás Administraciones públicas, permitieron iniciar en 2001 una inversión pública de 3.300 millones de euros: 1.850 millones de euros corresponden a transporte y los otros 1.450 millones de euros financian obras de medio ambiente.

En total, se han beneficiado de esta inversión del Fondo de Cohesión 281 proyectos que corresponden a más de 150 ciudades y 59 entidades supramunicipales. Todos los proyectos de transporte son ejecutados y cofinanciados por la Administración Central.

Los proyectos de medio ambiente son cofinanciados por las tres Administraciones públicas. En concreto, en el pasado ejercicio las Corporaciones Locales recibieron 545 millones de euros del Fondo de Cohesión para medio ambiente (el 50%), las Comunidades Autónomas, 371 millones de euros (34%) y el Estado recibió 176 millones de euros (el 16%).